GCRI · Biotechnologie et biosécurité

Sciences moléculaires et de la vie pour la biotechnologie et la biosécurité

How molecular and life sciences is applied in Biotechnology and Biosecurity. Molecular and life sciences study the structure and function of living systèmes from genes and proteins to cells and organisms. They underpin the understanding of pathogens, resistance, toxicity and biological innovation.

01Registre

Molecular and life sciences for biotechnology and biosecurity on the record.

Fiche de la méthodeMéthode STIM
  1. MéthodeSciences moléculaires et du vivant
  2. GarantBiotechnologie et biosécurité
  3. Appliqué dansBiotechnologie et biosécurité
  4. Données5 entrées
  5. VérificationsValidation
  6. Page canoniqueCommons STIM
02Candidature

What molecular and life sciences does here.

Molecular and life sciences study the structure and function of living systèmes from genes and proteins to cells and organisms. They underpin the understanding of pathogens, resistance, toxicity and biological innovation. In health and biosecurity and food and agriculture, life sciences support pathogen characterisation, résistance aux antimicrobiens tracking and biosecurity assessment. They inform how biological threats might spread through health, agriculture and trade. The canonical description is on les STEM Commons.

  1. 01

    Methods used here

    genome sequencing and assembly; phylogenetic analysis; functional assays; proteomics and metabolomics; cell and tissue culture; bioinformatic pipelines.

  2. 02

    Validation

    Results are confirmed through biological replicates, independent laboratories and orthogonal assays. Reference standards and proficiency testing check analytical accuracy.

03Simulateur

SEIR sur un réseau de lieux.

An outbreak seeded in one place spreads through a small-world network by the share of contacts people make elsewhere; play it to see the order of arrival and how the timing of measures moves the peak. Teaching model with stated illustrative values, not a prediction.

Commandes

Nombre de reproduction de base R0
2.5
Période de latence
3.0 days
Période infectieuse
5.0 days
Part des contacts établis dans d'autres lieux
8%
Lieux du réseau
24
Les mesures commencent au jour
40
Réduction des contacts due aux mesures
40%
Jours simulés
240 days

Relevés

Pic de nouvelles infections
4.42 per 1,000 a day
Jour du pic
176
Part ayant déjà été infectée
56%
Lieux atteints
100%
Nombre de reproduction sous mesures
1.50
Chiffres, méthodes et sources
JourNouvelles infections pour 1 000Infectés cumulés (%)
00.000.0
170.030.0
340.310.2
510.921.4
681.563.5
852.116.7
1022.3910.5
1192.6114.8
1363.1219.6
1533.8725.6
1704.3832.7
1874.3040.2
2043.6547.0
2212.5652.2
2381.4555.6

Méthodes

  1. Compartiments SEIR Kermack et McKendrick (1927), Proc. R. Soc. A 115
  2. Couplage de métapopulations par la mobilité Balcan and others (2009), PNAS 106
  3. Réseau petit monde Watts and Strogatz (1998), Nature 393
  4. Modélisation des maladies infectieuses Keeling and Rohani (2008), Princeton University Press
  5. Éventail d'incertitude (Monte Carlo sur les paramètres) Spiegelhalter, Pearson et Short (2011), Visualising uncertainty about the future, Science 333
  6. Sensibilité un facteur à la fois (tornade) Saltelli and others (2008), Global Sensitivity Analysis: The Primer, Wiley

Données

The model runs on the teaching values set by the controls. To calibrate it for a place, read it against these admitted layers and series, which this page’s map can draw:

  • Villes Natural Earth
  • Aéroports Natural Earth
  • Routes principales Natural Earth
SEIR sur un réseau de lieux. Modèle pédagogique illustratif : il fonctionne avec les valeurs fixées par les commandes, et non avec des données mesurées. Méthodes : compartiments SEIR (Kermack et McKendrick (1927), Proc. R. Soc. A 115) ; couplage de métapopulations par la mobilité (Balcan et al. (2009), PNAS 106) ; réseau petit monde (Watts et Strogatz (1998), Nature 393).
04Données

Ce que consomme la méthode.

Datasets and records used by molecular and life sciences on this platform, with the role each plays and the label its values carry. Sources are listed in le registre des sources.

DonnéesRôleÉtiquette
Sequencing instrumentsEntréeOBSERVÉ
Public sequence repositoriesEntréeOBSERVÉ
BiobanksEntréeOBSERVÉ
Laboratory assaysEntréeOBSERVÉ
Structural biology instrumentsEntréeOBSERVÉ
05Méthodes et preuves

The model, the data and the uncertainty.

Le modèle, ses hypothèses, ses données et son incertitude, sous la forme qu'un scientifique ou un ingénieur vérifierait. Les structures suivent des méthodes publiées. Les valeurs représentées sont illustratives, ce ne sont pas des résultats.

Bandes d'incertitude

How far the outlook for molecular and life sciences for biotechnology and biosecurity could spread, shown as ranges rather than a single line.

Maintenant+5+10+15+20+25+30 yélevéfaiblefourchette très probablefourchette probable
Estimation centrale
médiane de l'ensemble
Plages
probable et très probable, dans le langage calibré du GIEC
Ensemble
membres, scénarios et conditions initiales énoncés
À lire avec
la sensibilité du résultat à chaque entrée
Dispersion illustrative d'un ensemble sur une échelle d'indice ; la forme suit les orientations du GIEC sur l'incertitude. Il ne s'agit pas d'une projection.
Principes directeurs FAIR · GO FAIR et FORCE11W3C PROV · World Wide Web ConsortiumOrientations sur le traitement cohérent des incertitudes · GIECCEOS Analysis Ready Data · Comité sur les satellites d'observation de la Terre
06Validation

Comment les résultats sont vérifiés.

Results are confirmed through biological replicates, independent laboratories and orthogonal assays. Reference standards and proficiency testing check analytical accuracy.

Laboratory findings do not always translate to organisms or populations. Sampling bias in sequence databases limits generalisation.

08Intendance

Qui tient à jour la méthode.

Biotechnology and Biosecurity stewards molecular and life sciences for the Consortium and reviews how it is applied across platforms.

09Questions

Questions et réponses.

What are the limits of molecular and life sciences in this field?
Laboratory findings do not always translate to organisms or populations. Sampling bias in sequence databases limits generalisation.
Comment les résultats sont-ils vérifiés ?
Results are confirmed through biological replicates, independent laboratories and orthogonal assays. Reference standards and proficiency testing check analytical accuracy.
Les valeurs de cette page sont-elles réelles ?
The data names, roles and checks are real descriptions of practice. The canvas shows a design of the method’s use, not a run; no result is reported here.
Où d'autre cette méthode est-elle appliquée ?
Le page canonique de la méthode liste toutes les plateformes qui l'appliquent.
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