GCRI · Biotechnologie et biosécurité
Probabilités et statistiques pour la biotechnologie et la biosécurité
How probability and statistics is applied in Biotechnology and Biosecurity. Probability and statistics provide the mathematical framework for describing uncertainty and learning from data. They underpin estimation, testing and prediction in every risk discipline.
Probability and statistics for biotechnology and biosecurity on the record.
- MéthodeProbabilités et statistiques
- Appliqué dansBiotechnologie et biosécurité
- Données5 entrées
- VérificationsValidation
- Page canoniqueCommons STIM
What probability and statistics does here.
Probability and statistics provide the mathematical framework for describing uncertainty and learning from data. They underpin estimation, testing and prediction in every risk discipline. In health and biosecurity and food and agriculture, statistical methods quantify the likelihood and uncertainty of losses across interconnected systèmes. They make the evidence behind risk decisions explicit and reproducible. The canonical description is on les STEM Commons.
- 01
Methods used here
statistical inference; Bayesian analysis; regression modelling; sampling design; hypothesis testing; resampling methods.
- 02
Validation
Results are checked through diagnostics, cross-validation and sensitivity to assumptions. Independent replication confirms findings.
Tail fit.
L'écran qu'une équipe utiliserait pour suivre cette méthode : ses mesures, ses états et ses décisions. Les noms sont des exemples et les valeurs sont illustratives.
Tail fit
Biotechnology and biosecurity · Probability and statistics · Run R-0830
Return level curve
Fiche méthode
- Méthode
- Probabilités et statistiques
- Approche
- peaks over threshold
- Seuil
- 93th percentile
- Étiquette
- MODÉLISÉ
Paramètres
generalised Pareto fit
| Shape ξ | 0.20 | 0.00 | 0.41 | heavy tail if above zero |
| Scale σ | 2.0 | 1.0 | 7.5 | units of the variable |
| Exceedances | 98 | declustered |
Ce que consomme la méthode.
Datasets and records used by probability and statistics on this platform, with the role each plays and the label its values carry. Sources are listed in le registre des sources.
| Données | Rôle | Étiquette |
|---|---|---|
| Designed surveys and experiments | Entrée | OBSERVÉ |
| Observational datasets | Entrée | OBSERVÉ |
| Administrative records | Entrée | OBSERVÉ |
| Sensor time series | Entrée | OBSERVÉ |
| Simulation outputs | Entrée | OBSERVÉ |
SEIR sur un réseau de lieux.
An outbreak seeded in one place spreads through a small-world network by the share of contacts people make elsewhere; play it to see the order of arrival and how the timing of measures moves the peak. Teaching model with stated illustrative values, not a prediction.
Commandes
- Nombre de reproduction de base R0
- 2.5
- Période de latence
- 3.0 days
- Période infectieuse
- 5.0 days
- Part des contacts établis dans d'autres lieux
- 8%
- Lieux du réseau
- 24
- Les mesures commencent au jour
- 40
- Réduction des contacts due aux mesures
- 40%
- Jours simulés
- 240 days
Relevés
- Pic de nouvelles infections
- 5.28 per 1,000 a day
- Jour du pic
- 148
- Part ayant déjà été infectée
- 58%
- Lieux atteints
- 100%
- Nombre de reproduction sous mesures
- 1.50
Chiffres, méthodes et sources
| Jour | Nouvelles infections pour 1 000 | Infectés cumulés (%) |
|---|---|---|
| 0 | 0.00 | 0.0 |
| 17 | 0.03 | 0.0 |
| 34 | 0.32 | 0.2 |
| 51 | 0.96 | 1.4 |
| 68 | 1.74 | 3.7 |
| 85 | 2.72 | 7.5 |
| 102 | 3.74 | 13.1 |
| 119 | 4.56 | 20.2 |
| 136 | 5.11 | 28.5 |
| 153 | 5.24 | 37.4 |
| 170 | 4.44 | 45.7 |
| 187 | 2.91 | 52.0 |
| 204 | 1.52 | 55.6 |
| 221 | 0.69 | 57.3 |
| 238 | 0.30 | 58.1 |
Méthodes
- Compartiments SEIR Kermack et McKendrick (1927), Proc. R. Soc. A 115
- Couplage de métapopulations par la mobilité Balcan and others (2009), PNAS 106
- Réseau petit monde Watts and Strogatz (1998), Nature 393
- Modélisation des maladies infectieuses Keeling and Rohani (2008), Princeton University Press
- Éventail d'incertitude (Monte Carlo sur les paramètres) Spiegelhalter, Pearson et Short (2011), Visualising uncertainty about the future, Science 333
- Sensibilité un facteur à la fois (tornade) Saltelli and others (2008), Global Sensitivity Analysis: The Primer, Wiley
Données
The model runs on the teaching values set by the controls. To calibrate it for a place, read it against these admitted layers and series, which this page’s map can draw:
- Villes Natural Earth
- Aéroports Natural Earth
- Routes principales Natural Earth
Sur les six piliers, sous la conduite de Nexus Consortium
- Expériences Laboratoires
- Intégré Biotechnologie et biosécurité dans Foundry
- Testé à Biotechnologie et biosécurité dans Universe
- Codifié dans Santé et biosécurité dans Standards
- Publié dans Biotechnologie et biosécurité dans Reports
- Enseigné dans Faculté de santé et de société dans Academy
Comment les résultats sont vérifiés.
Results are checked through diagnostics, cross-validation and sensitivity to assumptions. Independent replication confirms findings.
Inference depends on assumptions about independence, distribution and sampling that may not hold. Small or biased samples limit reliability.
The model, the data and the uncertainty.
Le modèle, ses hypothèses, ses données et son incertitude, sous la forme qu'un scientifique ou un ingénieur vérifierait. Les structures suivent des méthodes publiées. Les valeurs représentées sont illustratives, ce ne sont pas des résultats.
Bandes d'incertitude
How far the outlook for probability and statistics for biotechnology and biosecurity could spread, shown as ranges rather than a single line.
- Estimation centrale
- médiane de l'ensemble
- Plages
- probable et très probable, dans le langage calibré du GIEC
- Ensemble
- membres, scénarios et conditions initiales énoncés
- À lire avec
- la sensibilité du résultat à chaque entrée
Thèmes qui s'appuient sur cette méthode.
Qui tient à jour la méthode.
Science des systèmes et modélisation stewards probability and statistics for the Consortium and reviews how it is applied across platforms.
Où mène cette page à travers le Consortium.
Questions et réponses.
What are the limits of probability and statistics in this field?
Comment les résultats sont-ils vérifiés ?
Les valeurs de cette page sont-elles réelles ?
Où d'autre cette méthode est-elle appliquée ?
Apportez des éléments de preuve depuis cette page.
Rapports is the Consortium’s quarterly publication. What you know about this subject can become evidence, a case or a correction in the next edition, credited to you and published under CC BY 4.0 where it is your own work.
- E-mailPasserelle GW-GCRIL'envoyer depuis cette pageUne preuve, une correction, un cas, une méthode, un examen, une traduction ou un apport au profil. Elle arrive étiquetée avec cette page, afin que le rédacteur responsable la reçoive.
- ZenodoDépôt ouvertLe déposer et le soumettre à la communautéPubliez votre propre fiche sur Zenodo avec votre identifiant ORCID, puis soumettez-la à la communauté Reports qui s'y trouve. Des curateurs l'examinent ; le DOI reste le vôtre.
- RapportsGCRIVoir toutes les façons de contribuerLes types de contribution, la manière dont chacune est examinée, la reconnaissance accordée, la licence et ce qui n'est jamais accepté.
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Apportez une méthode, un jeu de données ou une question.
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