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GCRI · Health Nexus

Épidémiologie pour la sécurité sanitaire

Epidemiology is the core science of this platform: it describes who becomes ill, where and when, identifies the determinants of disease, and evaluates what prevents it. Surveillance, outbreak investigation and burden estimation turn scattered reports into evidence that public health authorities can act on, with delays and biases stated.

01Registre

Epidemiology for health security on the record.

Fiche de la méthodeMéthode STIM
  1. MéthodeÉpidémiologie et science de la santé publique
  2. GarantHealth Nexus
  3. Appliqué dansHealth Nexus
  4. Données5 entrées
  5. Page canoniqueCommons STIM
02Candidature

What epidemiology and public health science does here.

Epidemiology studies the distribution and determinants of health and disease in populations. It provides the evidence used to detect outbreaks, estimate burden and evaluate interventions. In health and biosecurity, epidemiological evidence informs preparedness, resource allocation and the economic consequences of disease. It shows how health shocks interact with travel, labour, supply chains and public finance. The canonical description is on les STEM Commons.

Surveillance design and evaluation

Indicator-based reporting, sentinel sites and event-based signals are combined, and each stream is evaluated for sensitivity, timeliness, completeness and representativeness against agreed surveillance attributes.

Nowcasting under reporting delay

Delay distributions estimated from past reports adjust recent counts for cases not yet reported, so the latest weeks are shown with their uncertainty rather than as an artificial decline.

Indirect effects of service disruption

Expected service use and outcomes are modelled from trends before a shock and compared with observed data, separating the indirect harm of interrupted care from the direct effects of the shock.

03Géographie

Exposition environnementale en Afrique.

Population density, daytime surface heat and haze over Africa, from NASA GIBS. Each layer carries its own date.

La carte interactive requiert JavaScript ; la liste des couches et les sources figurent ci-dessous.

Couches 3

Exposition environnementale, pour cette page

À propos de cette couche
Preuves
Estimé
Sources
Gridded Population of the World v4.11 (NASA SEDAC (CIESIN, Université Columbia))
Fournisseur
NASA SEDAC (CIESIN, Université Columbia)
Licence
CC BY 4.0
Millésime
null ; estimation fondée sur le recensement, statique (2020)
Résolution
grille d'environ 1 km
Incertitude
Estimation fondée sur le recensement du nombre d'habitants par kilomètre carré en 2020, présentée comme contexte d'exposition ; ce n'est pas un décompte des personnes touchées par un aléa.
Accessible par
gibs.earthdata.nasa.gov, uniquement après que vous avez autorisé la carte en direct
À propos de cette couche
Preuves
Observé (une nébulosité persistante laisse encore des lacunes)
Sources
VIIRS NOAA-20 niveau 3, 8 jours (NASA LANCE)
Fournisseur
NASA LANCE
Licence
Données ouvertes de la NASA
Millésime
8 jours ; composite satellitaire sur 8 jours ; une nébulosité persistante laisse encore des lacunes
Les plus récents à la construction
2026-09-14
Résolution
grille d'environ 1 km
Incertitude
Température de peau du sol mesurée par satellite sur les 8 jours se terminant à la date indiquée, un indicateur d'exposition à la chaleur ; ce n'est pas la température de l'air, l'indice de chaleur ni une alerte de chaleur.
Accessible par
gibs.earthdata.nasa.gov, uniquement après que vous avez autorisé la carte en direct
À propos de cette couche
Preuves
Observé (les nuages laissent des lacunes)
Sources
VIIRS NOAA-20 Deep Blue AOD (NASA LANCE)
Fournisseur
NASA LANCE
Licence
Données ouvertes de la NASA
Millésime
quotidien ; restitution satellitaire ; les nuages laissent des lacunes
Les plus récents à la construction
2026-10-14
Résolution
grille d'environ 2 km
Incertitude
Mesure satellitaire de la brume sèche, de la fumée et de la poussière sur toute la colonne d'air le jour indiqué ; un indicateur d'exposition, et non les PM2.5 au niveau du sol, un indice de qualité de l'air ni un avertissement sanitaire.
Accessible par
gibs.earthdata.nasa.gov, uniquement après que vous avez autorisé la carte en direct
À propos de cette couche
Preuves
Observé
Sources
VIIRS NOAA-20, réflectance corrigée (NASA LANCE)
Fournisseur
NASA LANCE
Licence
Données ouvertes de la NASA
Millésime
quotidien ; image satellitaire
Les plus récents à la construction
2026-10-14
Résolution
grille d'environ 250 m
Incertitude
Image satellitaire. Raster satellitaire ou de modèle tel que le fournisseur le publie. Les nuages, les lacunes de fauchée et les erreurs de restitution laissent des lacunes et du bruit ; les valeurs sont des indicateurs, et non des mesures en un lieu donné.
Accessible par
gibs.earthdata.nasa.gov, uniquement après que vous avez autorisé la carte en direct
À propos de cette couche
Preuves
Modélisé (dernière année publiée par GIBS)
Sources
MODIS Terra et Aqua, occupation du sol (MCD12Q1) (NASA LP DAAC)
Fournisseur
NASA LP DAAC
Licence
Données ouvertes de la NASA
Millésime
annuel ; classification satellitaire ; dernière année publiée par GIBS
Les plus récents à la construction
2024-01-01
Résolution
grille d'environ 500 m
Incertitude
Classes d'occupation du sol par satellite pour l'année indiquée, y compris les terres cultivées ; une classification comportant des erreurs connues, et non un registre des exploitations agricoles.
Accessible par
gibs.earthdata.nasa.gov, uniquement après que vous avez autorisé la carte en direct
À propos de cette couche
Preuves
Observé (les nuages laissent des lacunes)
Sources
Produit VIIRS d'inondation mondiale (NASA LANCE)
Fournisseur
NASA LANCE
Licence
Données ouvertes de la NASA
Millésime
quotidien ; détection satellitaire ; les nuages laissent des lacunes
Les plus récents à la construction
2026-10-14
Résolution
grille d'environ 250 m
Incertitude
Détection satellitaire ; les nuages laissent des lacunes. Raster satellitaire ou de modèle tel que le fournisseur le publie. Les nuages, les lacunes de fauchée et les erreurs de restitution laissent des lacunes et du bruit ; les valeurs sont des indicateurs, et non des mesures en un lieu donné.
Accessible par
gibs.earthdata.nasa.gov, uniquement après que vous avez autorisé la carte en direct

Dernière version disponible

NASA GIBS / EOSDIS · ASTER GDEM (METI, NASA) · Blue Marble (NASA) · © contributeurs d'OpenStreetMap (ODbL) · Natural Earth

Chargement des dernières images de la NASA.

Faites glisser pour déplacer. Ctrl ou ⌘ et défilement, pincement ou boutons pour zoomer ; survolez pour lire les valeurs sous le pointeur ; la réinitialisation ramène à la région.

Exposition environnementale, cadrée sur l'Afrique.Produits satellitaires et de modèles tels que la NASA les publie, chacun avec sa propre date. Ce sont des indicateurs, non des évaluations d'un lieu quelconque.

Données : NASA GIBS · ASTER GDEM · Blue Marble · © contributeurs d'OpenStreetMap · Natural Earth · NASA EONET · NASA JPL OPERA DIST-ALERTSources et licences

  • We acknowledge the use of imagery provided by services from NASA’s Global Imagery Browse Services (GIBS), part of NASA’s Earth Science Data and Information System (ESDIS). Colours redrawn from the published colour map; values averaged into hexagonal cells where shown (modified). Données ouvertes de la NASA
  • We acknowledge the use of imagery provided by services from NASA’s Global Imagery Browse Services (GIBS), part of NASA’s Earth Science Data and Information System (ESDIS). Colours redrawn from the published colour map; values averaged into hexagonal cells where shown (modified). Données ouvertes de la NASA
  • Center for International Earth Science Information Network (CIESIN), Columbia University. 2018. Gridded Population of the World, Version 4 (GPWv4): Population Density, Revision 11. NASA Socioeconomic Data and Applications Center (SEDAC). Sous licence CC BY 4.0. Couleurs redessinées à partir de la palette publiée ; valeurs moyennées dans des cellules hexagonales lorsque présentées (modifié). doi:10.7927/H49C6VHW. CC BY 4.0
  • Produits VIIRS en quasi-temps réel (inondation, température de surface terrestre, couverture neigeuse, réflectance corrigée), NASA LANCE ; imagerie via NASA GIBS. Couleurs redessinées d'après la palette publiée ; valeurs moyennées dans des cellules hexagonales lorsque affichées (modifié). Données ouvertes de la NASA
  • Produits atmosphériques MODIS et VIIRS, NASA LANCE et LAADS DAAC ; imagerie via NASA GIBS. Couleurs redessinées à partir de la palette publiée ; valeurs moyennées en cellules hexagonales lorsqu'elles sont affichées (modifié). Données ouvertes de la NASA
  • Produits terrestres MODIS (indices de végétation, production primaire brute, occupation du sol), NASA LP DAAC et LANCE ; imagerie via NASA GIBS. Couleurs redessinées d'après la palette publiée ; valeurs moyennées dans des cellules hexagonales lorsque affichées (modifié). Données ouvertes de la NASA
  • ASTER GDEM est un produit du METI et de la NASA (ASTER Global Digital Elevation Model V003, NASA LP DAAC) ; imagerie via NASA GIBS. Couleurs redessinées d'après la palette publiée ; valeurs moyennées dans des cellules hexagonales lorsque affichées (modifié). Citer comme : NASA/METI/AIST/Japan Spacesystems and U.S./Japan ASTER Science Team (2019). ASTER Global Digital Elevation Model V003. doi:10.5067/ASTER/ASTGTM.003. Données ouvertes de la NASA
  • Réalisé avec Natural Earth. Données cartographiques vectorielles et matricielles libres sur naturalearthdata.com. Domaine public
  • © Contributeurs d'OpenStreetMap (ODbL), via NASA GIBS (côtes, frontières, routes et noms de lieux). Couleurs redessinées d'après la palette publiée ; valeurs moyennées en cellules hexagonales lorsqu'elles sont affichées (modifié). ODbL
  • Blue Marble, NASA Earth Observatory ; imagerie via NASA GIBS. Couleurs redessinées d'après la palette publiée ; valeurs moyennées dans des cellules hexagonales lorsque affichées (modifié). Données ouvertes de la NASA
  • Contexte sur le globe et la carte plane : côtes, frontières, routes et toponymes issus des couches de référence NASA GIBS (données OpenStreetMap, ODbL, © contributeurs d'OpenStreetMap) ; imagerie Blue Marble comme fond facultatif ; relief 3D et lecture de l'altitude à partir de l'indice de couleur d'altitude ASTER GDEM (classes de 5 m à 200 m, exagérées pour la lisibilité). Les frontières sont tracées telles que publiées et n'impliquent aucune position sur un territoire.
  • Événements en direct : suivi des événements naturels de l'Observatoire de la Terre de la NASA (EONET) ; les événements sont indicatifs et conservent les liens de leur source d'origine.
  • En direct : les événements NASA EONET sont indicatifs et ne constituent pas des alertes officielles.
  • Observed (EO): NASA JPL OPERA DIST-ALERT (contains modified Copernicus Sentinel data 2026). We acknowledge the use of imagery provided by services from NASA’s Global Imagery Browse Services (GIBS), part of NASA’s Earth Science Data and Information System (ESDIS).
  • NASA GIBS: We acknowledge the use of imagery provided by services from NASA’s Global Imagery Browse Services (GIBS), part of NASA’s Earth Science Data and Information System (ESDIS).
  • Prévision de la qualité de l'air, 5 jours, PM2.5 (CAMS via Open-Meteo) : contient des informations modifiées du Copernicus Atmosphere Monitoring Service 2026.
  • Année écoulée, température quotidienne (ERA5 via Open-Meteo) : contient des informations modifiées du Copernicus Climate Change Service 2026.
  • Données météorologiques d'Open-Meteo.com (https://open-meteo.com/), sous licence CC BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).
  • Les couches facultatives (14 sources dans la liste des couches : en direct, prévision, observées et contexte) affichent la mention de leur fournisseur sur la carte et ici lorsqu'elles sont activées ; les prévisions sont des sorties de modèles et les indices dérivés sont des estimations.

Couches et dates

  • Densité de population, 2020 : Population : CIESIN, Columbia University, Gridded Population of the World v4.11 (2018), NASA SEDAC, CC BY 4.0 · statique
  • Température de surface terrestre, jour, composite sur 8 jours : VIIRS NOAA-20 Level 3, 8-day, NASA LANCE · 14 sept. 2026
  • Épaisseur optique des aérosols, quotidienne : VIIRS NOAA-20 Deep Blue AOD, NASA LANCE · 13 oct. 2026
  • Couleurs naturelles : réflectance corrigée VIIRS NOAA-20, NASA LANCE · 13 oct. 2026
  • Type de couverture terrestre (IGBP), annuel : MODIS Terra and Aqua land cover (MCD12Q1), NASA LP DAAC · 2024
  • Eaux de crue, composite sur 3 jours : VIIRS Global Flood Product, NASA LANCE · 14 oct. 2026

04Données

Ce que consomme la méthode.

Datasets and records used by epidemiology and public health science on this platform, with the role each plays and the label its values carry. Sources are listed in le registre des sources.

DonnéesRôleÉtiquette
Notifiable disease reporting systèmesCase counts by place, time and personDÉCLARÉ
Sentinel influenza and respiratory surveillanceTrends under stable case definitionsOBSERVÉ
Vital registrationMortality baselines and excess deathsStatistiques publiées
Household and health surveysPrevalence and coverage with sampling weightsESTIMÉ
Routine health information systemsService volumes and facility reportingDÉCLARÉ
05Suivi

Epidemic model.

L'écran qu'une équipe utiliserait pour suivre cette méthode : ses mesures, ses états et ses décisions. Les noms sont des exemples et les valeurs sont illustratives.

Epidemic model

Health · Epidemiology for health security · Run R-8417

Rt above oneGCRI · Health Nexus

Courbe épidémique

Fiche méthode

Méthode
Épidémiologie et science de la santé publique
Modèle
SEIR, fitted
Generation time
5 days
Étiquette
MODÉLISÉ

Paramètres

Rt1.30.841.6
Doubling time (days)18429
Reporting fraction0.40.20.9
Epidemic model: the screen’s structure, terms and states for Health.Noms donnés à titre d'exemple et valeurs illustratives ; une conception, non un enregistrement ni un système en service.
06Validation

Comment les résultats sont vérifiés.

Findings are checked through replication, sensitivity analyses and comparison of independent surveillance streams. Transmission models are assessed by out-of-sample forecasting of case counts.

VérifierComment c'est fait
Surveillance attribute reviewSensitivity, timeliness, completeness and representativeness are assessed against established surveillance evaluation guidelines
Independent stream comparisonTrends in notifications are compared with laboratory, sentinel and mortality data before a change is described
Case definition stabilityChanges in definitions, testing or reporting are logged and their effect on trends assessed
Out-of-sample scoringTransmission models are scored on periods they were not fitted to

Reporting delays, under-ascertainment and confounding bias estimates. Behaviour change during outbreaks alters the parameters models rely on.

07Simulateur

SEIR sur un réseau de lieux.

An outbreak seeded in one place spreads through a small-world network by the share of contacts people make elsewhere; play it to see the order of arrival and how the timing of measures moves the peak. Teaching model with stated illustrative values, not a prediction. The map on this page shows Africa; the model itself is not tied to a place.

Commandes

Nombre de reproduction de base R0
2.5
Période de latence
3.0 days
Période infectieuse
5.0 days
Part des contacts établis dans d'autres lieux
8%
Lieux du réseau
24
Les mesures commencent au jour
40
Réduction des contacts due aux mesures
40%
Jours simulés
240 days

Relevés

Pic de nouvelles infections
4.02 per 1,000 a day
Jour du pic
186
Part ayant déjà été infectée
55%
Lieux atteints
100%
Nombre de reproduction sous mesures
1.50
Chiffres, méthodes et sources
JourNouvelles infections pour 1 000Infectés cumulés (%)
00.000.0
170.020.0
340.240.2
510.741.1
681.452.9
852.336.2
1022.9510.8
1193.0716.0
1363.1221.2
1533.4226.7
1703.8332.9
1874.0139.6
2043.6646.2
2212.7151.7
2381.5755.2

Méthodes

  1. Compartiments SEIR Kermack et McKendrick (1927), Proc. R. Soc. A 115
  2. Couplage de métapopulations par la mobilité Balcan and others (2009), PNAS 106
  3. Réseau petit monde Watts and Strogatz (1998), Nature 393
  4. Modélisation des maladies infectieuses Keeling and Rohani (2008), Princeton University Press
  5. Éventail d'incertitude (Monte Carlo sur les paramètres) Spiegelhalter, Pearson et Short (2011), Visualising uncertainty about the future, Science 333
  6. Sensibilité un facteur à la fois (tornade) Saltelli and others (2008), Global Sensitivity Analysis: The Primer, Wiley

Données

The model runs on the teaching values set by the controls. To calibrate it for a place, read it against these admitted layers and series, which this page’s map can draw:

  • Villes Natural Earth
  • Aéroports Natural Earth
  • Routes principales Natural Earth
SEIR sur un réseau de lieux. Modèle pédagogique illustratif : il fonctionne avec les valeurs fixées par les commandes, et non avec des données mesurées. Méthodes : compartiments SEIR (Kermack et McKendrick (1927), Proc. R. Soc. A 115) ; couplage de métapopulations par la mobilité (Balcan et al. (2009), PNAS 106) ; réseau petit monde (Watts et Strogatz (1998), Nature 393).

Sur les six piliers, sous la conduite de Nexus Consortium

09Simulateur de jumeau et de cascade

Model epidemiology for health security as a system. Run the cascade.

Assembled from the Nexus Standards area profile Sécurité sanitaire et Une seule santé: the hazards it names, the systèmes and sectors that carry the loss, the controls that dampen it and the data that observe it. Choose the components, pick an initiating hazard and step through the cascade. The Map view places the run on an example geography with open data. Every coupling weight is a stated assumption you can change. A teaching model, not a forecast, an assessment or a certification. To model a place of your own choosing, open the full Constructeur de systèmes.

Aléas

Commandes

  • NS-0 Constitution et principes
  • NS-3 UNI des enregistrements de risque (grammaire, table de correspondance héritée, autorité d'attribution)
  • NS-9 UNI contextuels (déploiements, instances, instances de programme)
  • NS-10 Politiques et clauses (obligations lisibles par machine : définition, caractère contraignant, évaluation et application)
  • NS-11 Vérification et suivi (éléments probants, attestations, observation de la conformité zero trust)
  • NRS-H83 Famille d'aléas : défaillance de la capacité du système de santé (NHS-1 health.system)
  • NRS-H42 Famille d'aléas : infections humaines rares et persistantes (NHS-1 health.other-human)
  • NRS-H41 Famille d'aléas : débordement de l'animal à l'humain (NHS-1 health.zoonotic)
  • NRS-H43 Famille d'aléas : épizooties du bétail et de l'aquaculture (NHS-1 health.animal-health)
  • NRS-D3 Réponse humanitaire et relèvement résilient
  • NRS-H46 Famille d'aléas : atteintes environnementales et liées aux produits pour les personnes (NHS-1 health.harm)

Observation

  • WHO Disease Outbreak News (listed for reference)
  • WAHIS animal health events (listed for reference)
  • WorldPop gridded population (listed for reference)
  • Règlement sanitaire international capacity and health emergency preparedness
  • Percentage of bloodstream infections due to selected antimicrobial-resistant organisms

Géographie d'exemple

  • West Africa: 59 hexagonal cells
  • Lumières nocturnes de ce soir, pannes (VIIRS Day/Night Band), NASA GIBS
  • Eaux de surface à travers les nuages, 30 m (radar OPERA DSWx-S1), NASA GIBS
  • Intensité des précipitations, dernière demi-heure (IMERG), NASA GIBS
10Intendance

Qui tient à jour la méthode.

Health Nexus stewards epidemiology and public health science for the Consortium and reviews how it is applied across platforms.

11Risque et réponse

Risques couplés, réponse appliquée.

The sectors pandemic touches and how strongly they depend on each other: what a study has to observe and model together.

Choisir un contexte

ARisque couplé dans six secteurs6 / 15 relations

Secteurs · PandémieTension

Illustratif : une cascade pédagogique sur des valeurs pédagogiques, et non des mesures.
BRéponse appliquée dans six piliers10 / 18 transmissions

Piliers · PandémieKPI

Applications illustratives ; les valeurs sont des repères publiés, cités dans la restitution.

Dans ce contexteDépendance ou transfert ; plus le trait est épais, plus le lien est fortHors de ce contexte

Contexte

Pandémie

L'absence de personnel se propage des cliniques à l'exploitation du réseau, à la logistique et au travail agricole.

W · E · I · F · H · B

Risque

Secteurs
4 sur 6
Relations
6 sur 15
Couplage
0.41 part du total

Survolez un angle, une ligne ou une rangée pour le suivre des deux côtés.

Voie

Appliqué à la pandémie

L · F · U · S · R · A

Réponse

Piliers
4 sur 6
Transmissions
10 sur 18
Boucles
5 clos

Valeur attendue

Ce qui est en jeu
Plus de 60 milliards $pertes attendues par anCommission on a Global Health Risk Framework, 2016
Rendement de la résilience
–aucune valeur de référence publiée
Pertes évitées
–aucune valeur de référence publiée

Survolez un pilier, une ligne ou une rangée pour lire comment il est appliqué.

A : une cascade pédagogique (choc 0,6, gain 0,35, quatre tours) appliquée à des valeurs pédagogiques pour une ville-région type, et non à des mesures. B : applications illustratives et indicateur clé dont chaque pilier répond ; les valeurs sont des références publiées et citées, non des prévisions. Événements en cours : NASA EONET, en direct.

12Questions

Questions et réponses.

What are the limits of epidemiology and public health science in this field?
Reporting delays, under-ascertainment and confounding bias estimates. Behaviour change during outbreaks alters the parameters models rely on.
Comment les résultats sont-ils vérifiés ?
Findings are checked through replication, sensitivity analyses and comparison of independent surveillance streams. Transmission models are assessed by out-of-sample forecasting of case counts.
Les valeurs de cette page sont-elles réelles ?
The data names, roles and checks are real descriptions of practice. The canvas shows a design of the method’s use, not a run; no result is reported here.
Où d'autre cette méthode est-elle appliquée ?
Le page canonique de la méthode liste toutes les plateformes qui l'appliquent.
13Méthodes et preuves

How epidemiology for health security is modelled, measured and tested.

Le modèle, ses hypothèses, ses données et son incertitude, sous la forme qu'un scientifique ou un ingénieur vérifierait. Les structures suivent des méthodes publiées. Les valeurs représentées sont illustratives, ce ne sont pas des résultats.

Bandes d'incertitude

How far the outlook for epidemiology for health security could spread, shown as ranges rather than a single line.

Maintenant+5+10+15+20+25+30 yélevéfaiblefourchette très probablefourchette probable
Estimation centrale
médiane de l'ensemble
Plages
probable et très probable, dans le langage calibré du GIEC
Ensemble
membres, scénarios et conditions initiales énoncés
À lire avec
la sensibilité du résultat à chaque entrée
Dispersion illustrative d'un ensemble sur une échelle d'indice ; la forme suit les orientations du GIEC sur l'incertitude. Il ne s'agit pas d'une projection.
Principes directeurs FAIR · GO FAIR et FORCE11W3C PROV · World Wide Web ConsortiumOrientations sur le traitement cohérent des incertitudes · GIECCEOS Analysis Ready Data · Comité sur les satellites d'observation de la Terre
RapportsContribuer

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Rapports is the Consortium’s quarterly publication. What you know about this subject can become evidence, a case or a correction in the next edition, credited to you and published under CC BY 4.0 where it is your own work.

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